Фамилия Бачалгин — редкая, с неочевидной на первый взгляд корневой основой. Она почти наверняка происходит не от имени или профессии, а от прозвища, связанного с особенностями речи или поведения. На это указывает суффикс -ин, характерный для русских фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а, -я: Бачалга → Бачалгин.

Самая вероятная версия — связь с глаголом «бачать» или «бачалить», который в некоторых русских говорах (особенно северных и сибирских) означал «говорить», «болтать», «калякать». Соответственно, Бачалга — человек, который любит поговорить, балагур, говорун. Суффикс -лг- в прозвище — редкий, он придаёт слову оттенок действия или склонности к нему (сравните: «трещотка» от «трещать»). Таким образом, прозвище могло быть насмешливым, но беззлобным.

Менее вероятная, но возможная версия — искажение тюркского корня. В языках Поволжья и Сибири есть слова «бача» (мальчик, парень, ученик) и «балчы» (рыбак). Однако фамилия Бачалгин не похожа на типичные тюркские модели (там чаще встречаются -ов, -ев, -улы, -оглы). Скорее всего, если тюркское влияние и было, то слово переосмыслили на русской почве, «обрусев» с помощью суффикса -лг-.

Географически фамилия встречается крайне редко. Основные следы ведут в Пермский край и Кировскую область — регионы, где исторически смешивались русские северные говоры и финно-угорские языки. Это косвенно подтверждает версию о диалектном русском глаголе: именно в этих местах слово «бачать» фиксируется этнографами.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Бачалов, Бачаев — показывает, что Бачалгин стоит особняком. Бачалов и Бачаев чаще выводят от тюркского «бача» (мальчик) или от православного имени Варфоломей (в просторечии Бахвал, Бача). У Бачалгина же основа явно не имя, а прозвище-характеристика, что делает фамилию более «прозрачной» для этимолога, несмотря на её редкость.

Носители фамилии Бачалгин, скорее всего, потомки крестьян или мастеровых из северных губерний России. Прозвище Бачалга закреплялось за разговорчивым, общительным человеком, и со временем, после отмены крепостного права, перешло в наследственную фамилию.