Фамилия Бачукина — женская форма фамилии Бачукин, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени предка-мужчины. Основа фамилии — «Бачук» или «Бачука». Слово «бачук» в южнорусских и украинских говорах могло означать «батрак», «наёмный работник» или, реже, «непоседа», «вертлявый человек». В некоторых диалектах «бачука» — это ещё и уменьшительно-пренебрежительное обращение к барину или пану, что добавляет фамилии социальный оттенок: предок мог быть либо работником из простонародья, либо, напротив, получить ироничное прозвище за барские замашки.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Бачукин буквально означает «сын Бачука» или «человек из рода Бачука». Модель образования типична для русских фамилий, особенно на севере и в центральных областях, где «-ин» крепился к основам на -а, -я. В отличие от «-ов», который чаще встречается у фамилий от профессий и имён на согласный, «-ин» здесь подчёркивает личное прозвище.

Географически фамилия Бачукин (и Бачукина) редкая, но встречается в основном в Поволжье и на юге России — в Волгоградской, Саратовской, Ростовской областях. Это совпадает с ареалом украинского влияния, где слово «бачук» было в ходу. Встречаются также варианты с другим ударением: Бáчукин и Бачу́кин, что может указывать на разное происхождение — от имени Бачук или от глагола «бачить» (видеть) через форму «бачу» (я вижу), хотя последняя версия менее убедительна.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Бачурин, Бачков, Бачманов имеют другие суффиксы и иные корни. Бачукин стоит особняком: в ней нет уменьшительного суффикса, как в Бачурине (-ур-), и она не связана с географическими названиями. Скорее всего, фамилия образовалась от прямого прозвища в крестьянской среде, где социальный статус или поведение человека легко становились его вторым именем.