Фамилия Бадамшины образована от мусульманского мужского имени Бадамша, которое имеет сложную персидско-иранскую основу. Первая часть, badam, в персидском языке означает «миндаль» — на Востоке этот орех считался символом любви и весеннего аромата. Вторая часть, shah, восходит к иранскому языку и переводится как «царь, монарх». Со временем прямой титул утратил своё первоначальное значение и стал использоваться как усилительный компонент в именах, подчёркивая превосходство, отличие или значительность носителя. Таким образом, имя Бадамша можно понимать как «царственный миндаль» или «превосходный, как миндаль».

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе Бадамш- добавлен русский патронимический суффикс -ин, характерный для фамилий, образованных от имён, прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а или -я. Бадамшины — буквально «потомки Бадамши».

Фамилия относится к распространённому типу древних восточных фамилий, которые входили в русский именослов через тюркских носителей — выходцев из Золотой Орды, а также через печенегов и половцев. Корни фамилии уходят в XV–XVII века, когда многие нерусские дворяне поступали на службу к московским князьям и царям. Проникновению инонациональных основ в русские фамилии способствовал именно тот исторический факт, что значительная часть российского дворянства имела татарское, тюркское или персидское происхождение. Сведения о восточном родоначальнике Бадамшиных в родословных считаются достаточно точными, поскольку подтверждаются самим именем-основой, которое не было распространено среди славян.

Фамилия редкая. Её географическое бытование связано в основном с регионами Поволжья и Урала, где исторически были сильны татарские и башкирские общины. Встречаются Бадамшины и в современном Татарстане, и в Башкортостане. Сравнение с однокоренными фамилиями — Бадамян, Бадамов — показывает, что корень «бадам» чаще встречается в армянских и иранских фамилиях, тогда как русская форма с суффиксом -ин закрепилась именно у тюркоязычных народов, принявших православие или сохранивших двойную культурную идентичность.