Фамилия Бакалеева — женская форма мужской фамилии Бакалеев, и её происхождение напрямую связано с торговлей. Основа здесь — слово «бакалея», которое в русском языке обозначало сухие съестные товары: чай, сахар, крупы, муку, пряности. В XIX веке бакалейными лавками называли магазины, где торговали именно такими продуктами, в отличие от мясных или молочных рядов. Соответственно, Бакалеевым могли назвать либо владельца такой лавки, либо её приказчика — человека, который заведовал товаром.

Модель образования проста: к основе «бакале(я)» добавили суффикс -ев, который в русских фамилиях чаще всего указывает на принадлежность («чей?» — Бакалеев, то есть сын или потомок Бакалея). Интересно, что суффикс -ев, а не -ов, появился из-за мягкого окончания основы (на -ей). Если бы в основе было твёрдое окончание, мы бы получили фамилию Бакалеев — но исторически закрепился именно такой вариант.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на третий слог: Бакале́ева, хотя в разговорной речи можно услышать и Бакале́ева. Географически фамилия не привязана к одному региону — она встречается в центральной России, Поволжье и на Урале, что объясняется повсеместным распространением бакалейной торговли. Среди однокоренных фамилий — Бакалейников, Бакалейщиков, Бакалеев, все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами, указывающими на род занятий.

Споров о происхождении почти нет: версия с бакалейной торговлей — единственная убедительная. Редкая альтернатива — связь с диалектным глаголом «бакалить» (говорить, болтать), но она слабая, так как в русской ономастике прозвища от торговых терминов встречаются гораздо чаще, чем от глаголов речи. Таким образом, предки современных носителей фамилии с высокой вероятностью были людьми, чья жизнь была связана с лавкой и прилавком.