Фамилия Бахарь — один из тех редких случаев, когда прозвище прямо говорит о роде занятий или характере предка. В её основе лежит древнерусское слово «бахарь» — так называли говоруна, рассказчика, сказочника, а иногда, с лёгким оттенком неодобрения, и краснобая. Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был мастером устного слова: умел увлечь слушателей, знал былины, байки или просто славился острым языком. В среде, где грамотность была редкостью, таких людей ценили — они развлекали, учили и передавали новости.

Фамилия образована без дополнительного суффикса, по так называемой «нулевой» модели: прозвище Бахарь стало фамилией напрямую, что характерно для украинской и белорусской традиции, но встречается и в русских говорах. Впрочем, гораздо чаще от той же основы появлялись фамилии с патронимическими суффиксами — Бахарев, Бахорев. Ономастический словарь С. Б. Веселовского фиксирует обе формы в XV–XVI веках: Григорий Бахарь упоминается в 1564 году в Новгороде, а Неупокой Андреевич Бахорев — в 1551 году в Суздале. Самая ранняя запись относится к 1495 году: Феофан Бахарев, новгородский крестьянин.

Интересно, что прозвище Бахарь могло быть не только личным, но и профессиональным: в некоторых диалектах «бахарь» означало не просто болтуна, а знатока обрядовых текстов или заклинателя, что роднит его с «бахарями» — сказочниками-профессионалами, которых держали при княжеских дворах. Таким образом, фамилия Бахарь может указывать на предка, который не просто любил поговорить, а владел словом как ремеслом.