Фамилия Бакшеев (и её варианты, в том числе Бакшеевы) образована от прозвища Бакша. Версий его происхождения несколько, и все они уводят нас на восток, в тюркскую языковую среду. Самая распространённая гипотеза связывает прозвище со словом bahshish — «чаевые», «подарок», «вознаграждение». В таком случае Бакшой могли назвать щедрого человека, который не скупился на угощение или плату.

Вторая версия отталкивается от тюркского bakish — «взгляд» или «взор». Прозвище могло закрепиться за человеком с выразительными глазами, острым или пристальным взглядом. Третье значение — более конкретное и социальное. У калмыков «бакша» означало настоятеля или старшину среди жрецов-гелюнгов, а у киргизов — шамана, гадателя и лекаря, который предсказывал будущее по трещинам на бараньих костях. Эта версия указывает на возможную связь родоначальника фамилии с религиозной или знахарской практикой.

Словообразовательная модель проста: к основе Бакша добавили типичный русский суффикс принадлежности -ев, превратив прозвище в отчество, а затем — в фамилию. Форма Бакшеевы — это множественное число, указывающее на род или семью.

О точном времени и месте возникновения фамилии говорить сложно: процесс её формирования шёл постепенно, по мере того как прозвище закреплялось за потомками. Ясно одно: корни Бакшеевых лежат в тюркской культуре, и сама фамилия — памятник давних контактов между русскими и восточными народами.