По одной из версий, фамилия Баку образована от лезгинского мужского имени Баку, которое в переводе означает «рожденный, родился». Таким образом, это имя могли дать долгожданному первенцу или первому мальчику в семье. Однако существует гипотеза, что имя Баку – это вариант арабского имени Баки, которое переводится как «вечный», «крепкий». Такое имя могли дать ребенку с пожеланием здоровья и долгих лет. Однако существует гипотеза, что фамилия Баку является румынской и восходит к названию города Бакэу (альтернативные названия - Bacău, Bacau, Bakuu, Bako, Бакъу, Bákó). В этом случае в основе фамилии лежит прозвище Баку, которое мог получить выходец из этого города.