Фамилия Бакукина — женская форма от Бакукин, и её разумнее всего разбирать именно через мужской вариант. Основа здесь — прозвище или некалендарное имя Бакука. Слово «бакука» в русских говорах имело два основных значения. Первое — «пустомеля», «болтун», «хвастун» (от глагола «бакулить» — говорить, болтать). Второе, более редкое, — «бакуня» или «бакун» означало сорт дешёвого пахучего табака, а также самого курильщика или торговца этим табаком. Таким образом, предок-родоначальник получил уличное прозвище за привычку много и красноречиво говорить либо за пристрастие к курению или торговле определённым табаком.

Словообразовательная модель типична для северных и центральных областей России. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Бакукин — сын Бакуки. В этом смысле фамилия стоит в одном ряду с такими, как Балакин (от «балакать»), Болтунов, Говорков. Интересно, что корень «бакул-» дал жизнь и другим фамилиям — Бакулев, Бакулин, Бакулов. Бакукина, с характерным для многих русских фамилий двойным «к» в основе, встречается реже, что делает её более локальной и конкретной по происхождению.

Географически фамилия тяготеет к бывшим Вятской и Пермской губерниям, а также к северу Поволжья — именно там диалектное слово «бакука» было в ходу. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Бакука, но документально закрепилась фамилия, скорее всего, уже после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным массово давали фамилии по уличным прозвищам их семей.

Носительницы фамилии могут быть уверены: их предки не были знатными дворянами (фамилия не оканчивается на -ский/-цкий и не встречается в родословных книгах), а относились к крестьянскому или мещанскому сословию. Прозвище, лёгшее в основу, не несло негативного оттенка — скорее, характеризовало живого, общительного человека или, в случае с табаком, мастера своего нехитрого ремесла.