Фамилия Балаболко образована от прозвища Балаболка. В основе лежит диалектное слово, которое имело два значения. С одной стороны, так называли шалуна, повесу, шутника и острослова — прозвище указывало на особенности поведения и характера предка. С другой стороны, «балаболкой» называли то, что болтается: висюльку, подвеску, колокольчик, кисточку. В этом значении прозвище могло стать профессиональным именованием: предок мог изготавливать или продавать украшения, либо просто любил их носить.

Фамилия оформлена суффиксом -к- и окончанием -о. Такая модель (Балаболк-о) характерна для украинской ономастики и указывает на западнорусское или малороссийское происхождение рода. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, -ин, форма на -ко (Балаболко) закрепилась в среде казачества и крестьянства на территориях современной Украины и юга России. Прозвище Балаболка со временем вытеснило наследственное имя и закрепилось в официальных документах как фамилия.

В русских говорах слово «балаболка» имело и другие оттенки: так могли назвать пустомелю, болтуна. Однако в фамилии, скорее всего, закрепилось первое, более безобидное значение — шутник или любитель побрякушек. Спор между версиями разрешается в пользу «профессиональной» гипотезы: суффикс -к- в украинских фамилиях часто маркирует прозвище по занятию, а не по черте характера.