Фамилия Балахоев образована от мужского тюркского имени Балах (Балаш), которое в переводе на русский язык означает «ребеночек», «дитятко». Согласно другой гипотезе, данная фамилия образована от прозвища Балахой, основой для которого послужило русское диалектное слово «балах» — «растение из семейства лютиковых». В таком случае Балахоем могли называть собирателя трав или лекаря, а также человека, рядом с домом которого произрастало это растение. Кроме того, не исключено, что прозвище Балахой связано с чеченским глаголом «балех» - «выручить из беды». В таком случае прозвище отражало особенности характера и поведение предка (забота о ближнем, способность оказать помощь).