Фамилия Балкашинов — одна из тех, где на слух всё кажется ясным, а при ближайшем рассмотрении начинаются вопросы. Корень «балкаш» интуитивно связывается с озером Балхаш в Казахстане, но для русского фамильного имени это объяснение самое слабое. Прямая топонимическая фамилия от названия озера возможна, но маловероятна: географические имена в основе фамилий обычно берут от названий городов, сёл и рек, а не от крупных озёр, к тому же нерусских. Озеро Балхаш стало широко известно в имперский период, а фамилия, скорее всего, старше.

Надёжнее версия от тюркского прозвища или личного имени. В тюркских языках «балкаш» (или «балкас») могло означать «грязь», «болото», «топь» — в переносном смысле так могли назвать человека неопрятного или, наоборот, живущего у болотистой местности. Суффикс «-ин» в фамилии Балкашинов — классический русский патронимический показатель («чей?»), но он присоединён к основе, которая уже содержит тюркский суффикс «-аш». Получается цепочка: тюркское прозвище Балкаш → русское отчество Балкашин → фамилия Балкашинов. То есть предка звали Балкаш, его сына — Балкашин, а внук уже стал Балкашиновым. Такая двойная русификация характерна для фамилий, которые складывались на окраинах русского государства, где смешивались славянские и тюркские антропонимические традиции.

Есть и третья, более прозаичная версия: от слова «балка» в значении «овраг» или «бревно». Тогда Балкаш — это человек, живший у балки (оврага) или работавший с балками (строитель, плотник). Суффикс «-аш» в русских прозвищах встречается (ср. Глазаш, Лобаш), но редко. Эта версия слабее тюркской, потому что от «балки» естественнее образовалась бы фамилия Балкин или Балков, а не Балкашин.

Фамилия редкая. В дореволюционных справочниках и метрических книгах она встречается спорадически, преимущественно в южных губерниях России и в областях, граничащих с казахскими степями — Астраханской, Оренбургской, Ставропольской. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: предки Балкашиновых могли быть выходцами из казачьих или крестьянских семей, живших в зоне контакта с кочевыми народами. Сословно — скорее всего, однодворцы или государственные крестьяне, реже — казаки. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не значится.