Фамилия Баловацкий — редкий случай, когда суффикс -цк- сразу указывает на географическое происхождение, а не на прозвище отца или ремесло. Такие фамилии на -цкий/-ский в восточнославянской традиции чаще всего получали дворяне (по названию имения) или выходцы из Польши, Беларуси и Украины, где этот суффикс был массовым. Баловацкий — типичная «топонимическая» фамилия, образованная от названия населённого пункта вроде Балова, Балово или Баловацы.

Основа «Балов-» восходит к древнерусскому нецерковному имени или прозвищу Балуй. В старину «баловнем» называли не только избалованного ребёнка, но и шалуна, проказника — в этом слове не было современной отрицательной окраски, скорее бытовая характеристика живого, непоседливого человека. Имя Балуй встречается в документах XVI–XVII веков: например, в писцовых книгах упоминаются крестьяне и посадские с таким прозвищем. От него образовались фамилии Балуев, Балов, Балутин и, через топоним, Баловацкий.

Самый вероятный путь появления фамилии: предок носителя жил в селе или деревне, которая называлась Балова, Балово или Баловацы. Такие названия есть в исторических областях современной Беларуси и западной России (например, деревня Балово в бывшей Могилёвской губернии). Переселяясь в другое место, человек получал прозвище по месту прежнего жительства: «Баловецкий» — то есть выходец из Балова. Со временем суффикс закрепился, и фамилия стала наследственной.

Менее вероятная, но допустимая версия — искусственное образование фамилии в семинарской среде. Священникам иногда давали фамилии от корней, звучащих «по-книжному», и -цкий был популярным окончанием. Однако в случае Баловацкого это маловероятно: основа слишком бытовая, не «благородная» для духовного сословия, которое предпочитало греческие и латинские корни или названия церковных праздников.

Фамилия очень редкая. В современных базах данных она встречается точечно — в основном на западе России (Брянская, Смоленская области) и в восточной части Беларуси. Это подтверждает её локальное, западнорусское происхождение. Носители Баловацких, скорее всего, потомки крестьян или однодворцев из пограничных земель Речи Посполитой и Московского царства.