Фамилия Балтабекова — яркий пример тюркской антропонимии, перешедшей в русский обиход через модель с суффиксом -ов/-ев. В основе лежит мужское имя Балтабек, которое образовано сращением двух компонентов: «балта» (топор) и «бек» (господин, князь, предводитель). В тюркских языках имя с «балта» нередко давали с пожеланием, чтобы мальчик был сильным и решительным, как удар топора, или же в качестве оберега — чтобы злые силы «отсекались» от него. «Бек» же указывало на знатное происхождение или высокий статус. Таким образом, Балтабек — это «князь-топор» или «господин с топором», что звучало как комплимент мужеству и властности.

Основная масса носителей фамилии сосредоточена в Казахстане и среди казахов, живущих в России (особенно в Оренбургской, Астраханской областях и Алтайском крае). Встречается она и у киргизов, а также у некоторых народов Кавказа, где тюркские имена с «бек» были распространены. Фамилия женская, мужской вариант — Балтабеков.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий на -ов, которые происходят от крестильных имён или прозвищ, Балтабекова сохраняет прямую связь с доисламским и мусульманским пластом тюркской ономастики. Здесь нет христианского подтекста — это чисто родовая метка, указывающая на предка, который носил составное имя-титул. В документах XIX — начала XX века, когда казахов начали массово записывать в метрики, фамилию часто фиксировали как Балтабеков или Балтабекова, отталкиваясь от отчества (Балтабекович/Балтабековна). Так она и закрепилась.

Сравните с однокоренными фамилиями: Балтабаев (где «бай» — богач) или просто Балтаев. Балтабекова стоит особняком из-за второго компонента «бек», который в тюркских обществах часто указывал на принадлежность к военной или родовой аристократии. Поэтому, хотя сейчас это просто фамилия, её носители могут с большой вероятностью вести род от человека, занимавшего видное место в своём ауле или племени.