Фамилия Балухатин — редкая по структуре и звучанию. Она образована с помощью суффикса -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — сын Балухаты. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Балухата. Это слово, скорее всего, восходит к диалектному глаголу «балухать» или «балухаться» — шуметь, баловаться, проказничать. В некоторых говорах «балуха» — это шалун, озорник, непоседа. Так могли прозвать бойкого, живого человека, а затем прозвище закрепилось за его потомками.

В отличие от более распространённых фамилий на -ов/-ев, суффикс -ин встречается реже, но именно он даёт точную привязку к конкретному лицу, а не к роду занятий. Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где суффикс -ин особенно активен. Встречается она и на Украине, но там форма могла возникнуть независимо, от украинского «балухати» (болтать, пустословить).

Обратите внимание на вариант написания: ударение, скорее всего, падает на последний слог — Балуха́тин, так как суффикс -ин в фамилиях обычно ударный. В редких случаях, если основа происходит от имени с другим ударением, возможен вариант Балуха́тин с ударением на второй слог, но это менее вероятно.

Спорных версий у фамилии нет: корень прозрачен, а суффикс типичен. Единственное, что может сбивать с толку, — это искусственное желание связать «Балу» с чем-то тюркским или западным, но для этого нет ни фонетических, ни исторических оснований. Фамилия чисто славянская, прозвищная, и её носители в прошлом, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по отцу-озорнику.

Среди известных носителей фамилии выделяется филолог и текстолог Сергей Балухатин (1890-е — 1940-е), занимавшийся творчеством Гоголя и Чехова.