Фамилия Бардуков образована от прозвища Бардук. Оно ведет свое начало от аналогичного диалектного нарицательного со значением «суп из муки». Кроме того, в некоторых говорах Бардуком называли несостоятельного человека. Таким образом, прозвище Бардук может указывать на социальный статус предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бардук, со временем получил фамилию Бардуков.