Фамилия Бардюкова — это женская форма, а её мужской вариант — Бардюков. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Бардюк. Чтобы понять его происхождение, нужно заглянуть в диалектную лексику южнорусских областей, где слово «бардюк» означало «сорт яблок», а в некоторых говорах — «арбуз» или «дыня». Человек, получивший такое прозвище, мог быть садоводом, торговать бахчевыми или просто иметь круглую, «плодовитую» внешность.

Модель образования фамилии — суффикс -ов, самый распространённый в русской антропонимии. Он указывает на принадлежность: Бардюков — сын Бардюка. Такая патронимическая модель типична для центральных и южных губерний России, где фамилии на -ов доминировали. Интересно, что в отличие от более частых «фруктовых» фамилий вроде Яблоков или Грушев, Бардюков завязана на диалектное, локальное слово, что сужает круг её возможного происхождения до определённых регионов — скорее всего, Курской, Воронежской или Ростовской областей.

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с тюркским словом «бардак» — «беспорядок, путаница». В таком случае прозвище Бардюк могло характеризовать человека неаккуратного или суматошного. Однако фонетический переход «д» в «д'» (смягчение) в этом случае нетипичен для заимствований, поэтому версия с диалектным названием плода выглядит убедительнее.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Бардюкин, Бардюковский — показывает, что Бардюков/Бардюкова остаётся самой простой и прямой формой без лишних суффиксов, что говорит о её раннем сложении, ещё до массовой унификации фамилий в XIX веке. Фамилия редкая, в списках частотных русских фамилий она не встречается, что делает каждого её носителя обладателем уникального ономастического слепка с южнорусского говора.