Фамилия Бархонов — хороший пример того, как одно простое слово может таить в себе несколько разных историй. В её основе лежит прозвище или мирское имя Бархон, которое, скорее всего, имеет тюркские корни. Самая прямая и правдоподобная версия связывает его со словом «бархан» — песчаный холм в пустыне, наметённый ветром. В этом случае прозвище могли дать человеку с характерной внешностью (например, с пышными, «сыпучими» волосами) или тому, кто жил в песчаной местности. Менее очевидная, но тоже возможная версия — от диалектного глагола «бархать» или «бархнуть», означающего «шлёпнуть», «ударить», «бросить». Тогда Бархоном могли прозвать неуклюжего или, наоборот, резкого в движениях человека.

Суффикс -ов в фамилии указывает на стандартную русскую модель образования: Бархон → Бархонов, то есть «сын Бархона» или «принадлежащий Бархону». Это типичная «патронимическая» модель, которая закрепилась в качестве фамилии в XVI–XVII веках. Интересно, что фамилия Бархонов встречается в основном в центральных и южных регионах России, особенно в Поволжье и на Урале, где исторически было сильное тюркское влияние и песчаные ландшафты. Это косвенно подтверждает «барханную» версию происхождения.

Стоит различать фамилию Бархонов и очень похожие Барханов или Бархин. Барханов почти наверняка связан с тканью «бархат» — такое прозвище могли дать торговцу или мастеру по бархату. А Бархин — фамилия с другим суффиксом (-ин), часто указывающим на принадлежность к матери или жене, и её основа может быть как тюркской, так и еврейской (от имени Борух). Бархонов же стоит особняком: его корень не имеет отношения к дорогой ткани, а уходит в степные ландшафты или бытовые прозвища. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Бархонов не выделяется в отдельную группу, что говорит о его редкости и локальном бытовании.