Фамилия Баржина звучит необычно для русского уха, и её происхождение стоит искать не в названии речного судна, а в разговорных формах имён. Основа фамилии — мужское имя Баржа, которое в старину было уменьшительной или обиходной формой от канонических имён Варфоломей или Амвросий. В русской народной среде такие усечения (Баржа вместо Варфоломей) были обычным делом: язык упрощал длинные греческие имена до коротких, удобных в быту.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Баржин — «чей?» — «сын Баржи» или «человек из семьи Баржи». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я. Если бы основа звучала как Барж, фамилия писалась бы Баржев, но форма Баржа дала именно Баржин.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с прозвищем Баржа — так могли назвать медлительного, грузного или неповоротливого человека по аналогии с тяжёлым речным судном. Однако в ономастических справочниках, например в работах Б. Унбегауна, такие прозвищные фамилии от названий барж не зафиксированы, а вот фонетическая связь с Варфоломеем прослеживается вполне отчётливо. Так что правдоподобнее всего, что предок носителя фамилии Баржина был просто Варфоломеем, которого в деревне звали Баржа.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и северных областях России, где имя Варфоломей было более употребительно в крестьянской среде. В отличие от фамилий Баржов или Баржевский, Баржина сохранила архаичную народную форму имени, что делает её особенно ценной для историка языка — это живой след того, как греческие имена перекраивались на русский лад.