Фамилия Басалкин образована по стандартной для русских фамилий модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «сын Басалки». Основа — Басалка — это не полное имя, а производная форма от какого-либо личного имени или прозвища.

Скорее всего, Басалка — это уменьшительно-бытовая форма от имени Басалай. В старину имя Басалай встречалось в новгородских и северных землях, а его основа — древнерусское слово «басала» (или «басало»), означавшее «красавец», «щеголь», «хвастун», «озорник». Словарь Даля фиксирует глагол «басалить» — «красоваться, щеголять». Таким образом, прозвище Басалай мог получить человек заметный, любящий принарядиться, или, напротив, бойкий и задиристый — в зависимости от контекста. Со временем Басалай в бытовой речи сократился до Басалка, и от этой формы пошла фамилия.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с тюркским корнем «баса» («наступать, давить»), но для русской фамилии Басалкин она выглядит натянутой, так как суффикс -ин и форма на -лка типичны именно для славянской антропонимии. Географически фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России, что подтверждает её исконно русское происхождение.

Социальный состав носителей был смешанным: в переписных книгах XVII–XVIII веков Басалкины фигурируют как крестьяне, посадские люди и мелкие служилые. Фамилия не относится к аристократическим, но и не единична: есть однокоренные Басалаевы, Басалины, Басаловы — все они восходят к тому же «басале»-красавцу.