Фамилия Батакшев образована от прозвища Батакша (Батакши). В переводе с тюркского языка «батак» означает «топь, болото». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Батакша (Батакши) получил человек, живший в заболоченной местности. Менее вероятно, что в основе этого прозвища лежит турецкое слово «батакчи»: так называли мошенника, а также человека, который быстро тратил все заработанное. Таким образом, потомок человека, которого звали Батакша (Батакши), со временем получил фамилию Батакшев.