Фамилия Батьковские — редкий пример фамилии, в которой переплелись сразу два возможных пути происхождения, и оба ведут к одному корню. Первая и наиболее прозрачная версия — топонимическая. Фамилия образована от названия населённого пункта Батьково. Таких деревень и сёл на карте России несколько: в Ленинградской, Московской и Новгородской областях. Предок, носивший фамилию Батьковский или Батьковские (форма множественного числа указывает на целый род или семейство), скорее всего, был выходцем из одного из этих мест. Типичный суффикс -ский/-цкий как раз и закреплял связь с географическим объектом: «тот, кто из Батькова».

Вторая версия — прозвищная, и она не менее интересна. Основой могло послужить слово «батька» — отец, батюшка. В старину так называли не только родителя, но и уважаемого мудрого старика, а также священника (попа, батюшку). Прозвище Батьковый могли дать ребёнку, которого воспитывал один отец, либо человеку, который походил на «батьку» — был рассудительным и авторитетным. В случае со священником прозвище могло перейти на его сына: «Батьковый» — значит «сын батюшки». Далее, по модели «чей?» — «Батьковский», фамилия закрепилась за потомками.

Форма «Батьковские» (а не «Батьковский») характерна для западных и юго-западных регионов Российской империи — современной Беларуси, Украины, западных областей России. Там фамилии на -ские/-цкие во множественном числе нередко обозначали целый род или шляхетскую семью. Таким образом, носители фамилии Батьковские могли иметь польские или литовские корни, особенно если их предки принадлежали к мелкой шляхте.

Точное время возникновения фамилии установить сложно: процесс закрепления фамильных прозвищ шёл несколько столетий. Однако можно с уверенностью сказать, что фамилия Батьковские — живой след либо конкретной географической точки, либо социального статуса и семейного уклада предков.