Фамилия Батковы образована от прозвища Баток, и её происхождение упирается в многозначное слово «бат». В русских говорах так называли долблёный из цельной колоды челн или грубое корыто, которым зимой кормили скотину. Если прозвище дали по этому значению, то предок Батковых мог быть лодочником, судостроителем или плотником, делавшим корыта.

Вторая версия ведёт к польскому «bat» — бич или кнут. Здесь Баток — скорее не ремесленник, а человек по характеру или занятию: погонщик скота, пастух, либо, в переносном смысле, суровый и властный хозяин, который держит всех «в ежовых рукавицах».

Сама фамилия построена по простой и типичной модели: прозвище на -ок (Баток) плюс типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Батка»). Это одна из самых массовых словообразовательных схем, по которой в России сложились тысячи фамилий. Географию бытования фамилии установить сложно, но по говорам слово «бат» встречается в северных и центральных областях, что может указывать на исходный ареал.