Фамилия Баяндина образована от тюркского имени Баянды, которое сложилось из двух элементов. Корень «баян» в древнемонгольском и древнетюркском языках означал «богатый», «сильный» или «счастливый». В арабском языке существует созвучное имя Баян со значением «ясный». Суффикс «-ды» в составе фамилии — характерный признак казахской или киргизской модели образования, где он указывает на принадлежность к роду или месту. Таким образом, предок носителей фамилии мог получить имя-пожелание богатства и удачи, а его потомки стали Баяндиными.

Окончательно определить точное место и время возникновения рода можно только на основании углублённых генеалогических изысканий. Однако сама словообразовательная модель подсказывает, что фамилия закрепилась в среде, где тюркские имена были основой для фамильных прозвищ, а суффикс «-ды» не был переосмыслен под русское окончание «-ин». В русской традиции фамилия получила привычное окончание «-а», превратившись в Баяндина, но сохранила тюркскую основу. Среди однокоренных фамилий можно встретить Баянова, Баязитова или Баяндиных — они различаются суффиксами, но восходят к тому же корню со значением достатка и силы.