Фамилия Байбинов напрямую связана с карачаево-балкарским личным именем Байбин. В основе этого имени лежит слово «бабына» или «байбинё» — так на Кавказе называют мелиссу лимонную, растение, известное в народе как «маточник». Имя, данное по названию травы, — не редкость для тюркских и кавказских культур: оно могло отражать пожелание здоровья, спокойствия или просто указывать на обстоятельства рождения ребёнка.

Модель образования фамилии проста: к основе Байбин прибавили русский патронимический суффикс -ов, который в прошлом означал «сын» или «потомок». Так, сын или внук человека по имени Байбин со временем стал писаться как Байбинов. Форма с суффиксом -ов, а не -ев, указывает на твёрдое окончание основы, что типично для русификации нерусских имён.

Стоит обратить внимание на географическую привязку. Фамилия Байбинов встречается преимущественно у карачаевцев и балкарцев, а также в среде родственных адыгских народов. В адыгской ономастике, кстати, тоже есть примеры имён, образованных от бытовых или растительных реалий: Калашау («городской парень»), Хагур («худой, тощий»), Учужук («сын ставшего на ноги»), Гучешау («сын кузнеца»). На этом фоне имя Байбин — не исключение, а часть местной традиции называть детей по предметам или явлениям окружающего мира.

В отличие от многих фамилий, чьё значение стёрлось за века, Байбинов сохраняет прозрачную этимологию: исходное слово до сих пор бытует в диалектах, а сам корень не оброс дополнительными мифическими толкованиями. Спорных версий происхождения у этой фамилии практически нет — все исследователи сходятся на «растительном» следе.