Фамилия Байбинов образована от карачаево-балкарского имени Байбин, которое восходит к слову «бабына/байбинё» - «маточник», т.е. мелисса лимонная. Например, у адыгов встречаются следующие имена: Калашау (в переводе «городской парень»), Хагур («худой, тощий»), Учужук («сын ставшего на ноги»), Гучешау («сын кузнеца»). Таким образом, потомок человека, которого звали Байбин со временем получил фамилию Байбинов.