Фамилия Байбирдин звучит непривычно для русского уха, но её происхождение укладывается в модель, хорошо знакомую историкам фамилий. Основа здесь — тюркское мужское имя Байбирде (Байбирди). Оно составное: «бай» означает «богатый», «господин», а «бирде» — «дал» (форма глагола «давать»). Имя Байбирде переводится как «бог дал богатство» или «господин даровал». Это типичное имя-пожелание, распространённое у татар, башкир и других тюркских народов.

Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: Байбирдин — «сын Байбирды» или «из рода Байбирды». Такие фамилии в XVI–XVII веках часто получали служилые татары, переходившие на русскую службу и принимавшие православие. Их записывали в документы с окончанием -ин, как у русских фамилий от имён на -а/-я (например, Ильин, Никитин). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от основ на согласный, -ин характерен для имён, оканчивающихся на гласный или мягкий согласный.

Географически фамилия Байбирдин встречается в Поволжье, Приуралье и Западной Сибири — в регионах, где исторически жили татары и башкиры. Встречаются варианты написания: Байбердин, Байбирдинов (с «натуральным» тюркским суффиксом -ов). В метрических книгах XIX века Байбирдиных можно найти среди государственных крестьян и мещан Казанской, Уфимской и Оренбургской губерний.

Споров о корне почти нет: версия тюркского имени Байбирде — основная и надёжная. Редкая попытка вывести фамилию от русского диалектного слова «байберда» (болтун, пустомеля) не подкреплена словарями и кажется натяжкой — гораздо логичнее объяснение через имя, тем более что фамилия явно не великорусская по звучанию.

Таким образом, Байбирдин — это фамилия-«паспорт», которая хранит память о тюркском предке с пожелательным именем. Носитель такой фамилии, скорее всего, происходит из среды поволжских татар или башкир, чьи имена в XVI–XVIII веках адаптировались к русской антропонимической системе.