Фамилия Байбордина — женская форма фамилии Байбордин, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — прозвище или имя Байборда, которое, скорее всего, имеет тюркские корни. В тюркских языках «бай» — это богатый, знатный, господин, а «борда» может восходить к слову «борду» (грязный, мутный) или к «борт» (мед, хмельной напиток). Получается два возможных смысла: «богатый грязнуля» (ироничное прозвище) или «знатный пьяница» (тот, кто пьёт дорогой хмельной мёд).

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Байбордин — это «сын Байборды». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Если бы основа была на согласную, стоял бы суффикс -ов, но здесь именно «чей?» — Байбордин. Фамилия редкая, географически привязана к Уралу и Зауралью, особенно к Пермскому краю и Свердловской области, где исторически было сильное тюркское влияние и смешение с русским населением.

Версия о чисто русском происхождении от слова «борода» (Байборода) менее правдоподобна: в русском языке приставка «бай-» нехарактерна, а форма «Байборода» — это уже отдельная фамилия, которая могла бы сократиться до Байборда, но звучит натянуто. Поэтому основная гипотеза — тюркское прозвище, которое дали человеку за характер или привычку, а затем оно закрепилось как фамилия при переходе в русскую среду. Носительницы фамилии Байбордина, скорее всего, потомки тех, кто жил на стыке культур и носил яркое, запоминающееся прозвище.