Фамилия Байбородин образована от прозвища Байборода. Скорее всего, оно происходит от старинного русского глагола, встречающегося в «Толковом словаре живого великорусского языка» В. Этот глагол имеет значение «болтать, пустословить». Поэтому шутливое прозвище Байборода мог получить болтун, любивший приврать ради «красного словца». Кроме того, однокоренное существительное «байбара» в архангельских говорах употреблялось в значении «бесценок, дешевизна». В таком случае Байборой в народе могли прозвать простоватого, доверчивого человека. Первые упоминания о прозвище Байборода и об образовавшейся от него фамилии относятся к XV столетию, о чем свидетельствуют записи в «Ономастиконе» академика С.Б. Веселовского: Авксентий Байборода, 1406 г., Псков; Борис Байбородин, крестьянин, 1624 г., Нижний Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Байборода, со временем получил фамилию Байбородин.