Фамилия Байдерин образована от прозвища Байдера, и чтобы понять её корни, нужно разобраться с многослойной основой. Сама основа восходит к украинскому слову «байда», у которого как минимум два значения. Первое — «беззаботный человек, гуляка, повеса»; второе, более бытовое — «ломкий или хрупкий кусок хлеба, сахара, дерева». В первом случае прозвище указывало на черты характера: беспечность или легкомыслие. Во втором — могло даваться человеку за физические особенности, например, худощавость или жилистость. Именно эта версия, связывающая прозвище с внешностью, встречается реже других и делает фамилию неочевидной на первый взгляд.

Однако есть и третья, профессиональная версия, которую стоит рассмотреть внимательнее. Согласно ей, прозвище Байдера этимологически связано со словом «байдак». Так в старину называли речное парусное судно, распространённое на Днепре и его притоках. Соответственно, Байдерой могли прозвать строителя, хозяина или работника такого судна. Это типичное «профессиональное» именование, которое перешло в фамилию. Примечательно, что в украинском языке суффикс -ер- в подобных прозвищах встречается нечасто, что выделяет Байдерина на фоне более распространённых фамилий на -ак или -ук.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Байдерин, то есть сын или потомок Байдеры. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а. При этом сама основа прозвища явно западнорусского или украинского происхождения, что может говорить о географическом пути фамилии: из южных или юго-западных земель в центральные области России. Таким образом, фамилия Байдерин — это компактный след сразу нескольких возможных историй предка: либо он был беспечным гулякой, либо худощавым и жилистым человеком, либо имел отношение к речному судоходству.