Фамилия Байдинов образована от личного имени Байдин, которое в свою очередь сложилось из двух корней. Первый — древнетюркское «бай», означавшее «хозяин», «богатый», «могущественный господин». Второй — арабское «дин», то есть «вера», «религия». В буквальном прочтении имя Байдин — «богатый верой», и родители, давая его сыну, желали ему стать достойным мусульманином.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе Байдин добавили типичный русский патронимический суффикс -ов, превратив имя отца в фамилию потомков. Байдиновы — буквально «дети Байдина». Такое оформление характерно для фамилий, возникших в среде крещёных татар или других тюркских народов, вошедших в состав Российского государства.

Интересно, что фамилия Байдинов фиксируется в основном в регионах с компактным проживанием татар и башкир — в Оренбургской, Челябинской областях, в Башкортостане и Татарстане. География указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, мусульманами, принявшими православие или сохранившими веру, но получившими фамилию по русскому образцу. В дворянских родословных книгах фамилия не встречается, что говорит о её преимущественно крестьянском или мещанском происхождении.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда Байдинова пытаются сблизить с башкирским словом «байын» (знак, метка) или монгольским «байда» (положение, состояние), но эти гипотезы слабы: суффикс -ин в основе имени объясняется арабским «дин», а не тюркским окончанием. Надёжнее держаться двукорневого разбора.

Фамилия нередкая, но и не массовая: по данным открытых телефонных справочников, в России живёт около полутора тысяч Байдиновых. Среди них нет широко известных исторических деятелей или публичных персон, что типично для фамилий, сформировавшихся в сельской среде в XVIII–XIX веках.