Фамилия Байдинова — женская форма фамилии Байдинов. Её основательницей могла стать женщина, носившая фамилию мужа или отца. Сама фамилия Байдинов в свою очередь образована от прозвища или личного имени Байда. Слово «байда» многозначно, и у филологов нет единого мнения, какое именно значение легло в основу.

Самая распространённая версия отсылает к нарицательному «байда» — так называли промысловое судно (лодку-долблёнку) на Дону и Каспии. В этом случае прозвище Байда мог получить лодочник, рыбак или хозяин судна. Вторая группа значений слова — «беззаботный гуляка, повеса» или, напротив, «кусок ломкого, хрупкого» (хлеба, сахара, дерева). Здесь прозвище носило бытовой или ироничный оттенок.

Есть и тюркская гипотеза, которую не стоит сбрасывать со счетов. Она разлагает фамилию на два корня: «бай» (богатый, могущественный хозяин, господин) и «дин» (вера, религия). Если это так, то основатель рода Байдиновых мог быть состоятельным и влиятельным человеком, при этом глубоко верующим. Такое сложение двух корней характерно для тюркских имён и прозвищ.

Суффикс -ов в фамилии Байдинов (а значит, и -ова в Байдиновой) указывает на русскую модель образования: «чей?» — «сын Байды» или «потомок Байды». Фамилия относительно редкая, и её география не привязана к одной области — носители встречаются и в Поволжье, и в Сибири, что подтверждает смешение русской и тюркской традиций.