Фамилия Байкачёв образована по редкой для русских фамилий модели: суффикс -ёв, указывающий на принадлежность, присоединён к основе, оканчивающейся на шипящий звук. В русской ономастике фамилии на -ёв (Борщёв, Лещёв, Хрущёв) фиксируют ударение на окончании. В фамилии Байкачёв ударение, скорее всего, падает на последний слог — Байкачёв.

Корень фамилии — прозвище Байкач или Байкач. Слово «байкач» в русских говорах не зафиксировано, но его можно связать с тюркским корнем «бай» — богатый, господин, хозяин. В тюркских языках этот корень часто входит в состав имён и прозвищ (Баймурат, Байрамбек). Вторая часть — «кач» — может быть глагольной основой со значением «уходить», «убегать» или же диалектным вариантом слова «кач» (качели, качка). В таком случае прозвище Байкач могло означать «богатый беглец», «удачливый кочевник» или «тот, кто качает богатство» — в переносном смысле удачливый торговец или меняла.

Более прозаичная версия: прозвище Байкач могли дать человеку, который постоянно переезжал, «качался» с места на место, но при этом был зажиточным. Или же, наоборот, так называли бедняка, который «убежал от богатства» — ироничное прозвище.

Фамилия редкая. По данным переписей и телефонных справочников, основная масса носителей живёт в Ростовской области и Краснодарском крае — регионах, где исторически смешивались русские и тюркские народы, особенно казаки. Среди донских казаков было много фамилий тюркского происхождения, и Байкачёв вполне могла возникнуть именно в казачьей среде, где прозвища часто давали по внешним или бытовым признакам.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Байкалов (от байкал — озеро или тюркское имя), Байков (от бай — богатый). Байкачёв стоит особняком из-за суффикса -ёв и шипящей основы, что делает её более южнорусской или украинской по происхождению. В украинском языке суффикс -ч- часто встречается в прозвищах (Ковальчук, Шевчук), и Байкач могло быть украинским прозвищем, которое затем обрусело с добавлением -ёв.

Таким образом, носитель фамилии Байкачёв, скорее всего, потомок человека, которого в южнорусских или казачьих землях прозвали Байкач — по тюркскому корню, указывающему на богатство или удачу, либо по диалектной черте поведения.