Фамилия Байкаев обычно вызывает ассоциацию с озером Байкал, но в действительности её корни лежат в тюркском именослове. Основа фамилии — личное имя Байкай. Оно образовано от тюркского слова «бай» (богатый, господин, хозяин) с помощью уменьшительно-ласкательного аффикса -кай. То есть Байкай — это «богатенький», «господчик», форма, которая могла быть как ласковым прозвищем ребёнка в семье, так и именем, данным с пожеланием достатка.

В разных тюркских языках имя могло звучать как Байка, Байкей, Байко. Фамилия на -ев указывает на русскую модель оформления: «чей?» — Байкаев, то есть сын или потомок Байкая. Это типичная ситуация для народов Поволжья, Кавказа и Средней Азии, где тюркское имя обрастало русским патронимическим суффиксом во времена переписей и оформления документов в XIX–XX веках.

Географически фамилия Байкаев чаще всего встречается у осетин, чеченцев, ингушей и татар. У осетин, например, имя Байкай (или Байко) фиксируется в исторических источниках как мужское имя, и фамилия Байкаевы (Байкатæ) известна в Дигорском ущелье. У чеченцев и ингушей возможна связь с именем Байка (вариант Бай-Ахмад или Бай-Хаджи), где «бай» — уважительная приставка к имени. У татар и башкир фамилия могла возникнуть от имени Байкай как производного от Баймухамет, Байбулат и т.п.

Интересная деталь: написание «Байкаев» с буквой «а» в корне отличает фамилию от однокоренной Байков (от имени Байко). Если бы фамилия произошла напрямую от названия озера, она звучала бы как Байкальский или Байкалов. Но Байкаев — это именно «сын Байкая», а не «живущий у Байкала».