Фамилия Байсартов — одна из тех, что рождается из личного имени, а не из прозвища или профессии. В её основе лежит восточное мужское имя Байсарт. Это имя составное, и его корни уходят в арабский язык. Первая часть — «бай» — означает «богатый человек, господин». Вторая часть — «сарт» — сложнее: она отсылает к историческому термину «сарты», которым в Средней Азии называли оседлое, преимущественно узбекское население, издавна жившее в городах и занимавшееся земледелием и торговлей.

Имя Байсарт, таким образом, могло нести двойную информацию о предке: указывать и на его этническую принадлежность (сарт), и на социальный статус (богатый, господин). Вполне вероятно, что так называли человека зажиточного, из оседлой узбекской среды, чтобы подчеркнуть его положение. Фамилия же образовалась по русской модели: к основе Байсарт прибавили типичный русский суффикс принадлежности -ов, который отвечает на вопрос «чей?». Буквально Байсартов — это «сын (или потомок) Байсарта».

Стоит отметить, что слово «сарт» — не просто этноним. В дореволюционной русской этнографии и в быту «сартами» часто называли оседлое население Туркестана, противопоставляя его кочевникам. Поэтому фамилия Байсартов — редкий случай, когда в основе имени лежит не столько личное качество, сколько маркер образа жизни и происхождения. Встречается она преимущественно у народов Северного Кавказа, особенно у чеченцев и ингушей, куда могла попасть вместе с переселенцами или через связи с торговцами из Средней Азии.