Фамилия Байтикенов — одна из тех, что сразу указывает на тюркские корни, а точнее — на казахскую или киргизскую среду. Её основа, имя Байтикен, составная: «бай» (богатый, могущественный, господин) и «тикен» (колючка, шип, терновник). Получается необычное прозвище — «богатая колючка» или «господин-шип». Звучит парадоксально, но в кочевой культуре такие имена-обереги были делом обычным: считалось, что неблагозвучное или колючее имя отпугнёт злых духов и не привлечёт завистников. Ребёнка могли назвать Байтикеном, желая ему одновременно богатства и защиты от сглаза.

Словообразовательная модель проста: к личному имени Байтикен добавили русский патронимический суффикс -ов. Это типичная история для XIX–XX веков, когда при переходе на оседлость и получении документов казахские имена русифицировали по привычному шаблону: Байтикен → сын Байтикена → Байтикенов. Суффикс -ов, а не -ев или -ин, указывает, что основа заканчивается на твёрдый согласный.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям Казахстана, а также к приграничным районам России (Оренбуржье, Астраханская область), куда в XIX веке переселялись казахи. Встречается она и в Киргизии, но реже: там более распространён вариант Байтикенов с тем же значением, но с местными диалектными особенностями произношения.

Сословно предки носителя фамилии, скорее всего, были скотоводами-кочевниками или мелкими землевладельцами. В родословных казахов (шежире) имя Байтикен могло закрепиться за основателем рода или аула. Никакой аристократии или знати тут нет — фамилия бытовая, народная, что не делает её менее интересной для этимолога: в ней сплелись тюркская образность и русская канцелярская традиция.