Фамилия Бедунова — яркий пример того, как наши предки использовали имя как оберег. В её основе лежит древнерусское мирское имя Бедун, которое происходит от слова «беда». Может показаться странным называть ребёнка «несчастьем», но в этом был особый родительский расчёт: считалось, что имя-оберег отведёт от сына настоящие беды. Назвав мальчика Бедуном, родители как бы «обманывали» злые силы, показывая, что худшее уже случилось, и теперь жизнь должна сложиться благополучно.

Есть и другое объяснение. Прозвище Бедун могли дать уже взрослому человеку, на долю которого выпало много горестей. Такое прозвище не обязательно было обидным — скорее, оно отражало тяжёлую судьбу. В любом случае, основа фамилии — слово «беда», а суффикс -ун характерен для прозвищ, описывающих человека по его свойству или состоянию.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе Бедун добавили патронимический суффикс -ов, который указывал на принадлежность («чей?» — сын Бедуна). Со временем форма Бедунов закрепилась как фамилия, а её женский вариант — Бедунова. Следы этой фамилии встречаются в Сибири. В Книге памяти Красноярского края записан Бедунов Яков Иванович, родившийся в 1873 году и живший в деревне Кизенжуль Шалинской волости Красноярского округа Енисейской губернии. Эта запись — одно из немногих документальных свидетельств, привязывающих фамилию к конкретной местности и времени.