Фамилия Беглоян — типичная армянская фамилия с суффиксом -ян, который в армянском языке (как и его вариант -янц) означает принадлежность к роду: «из семьи Бегло» или «потомок Бегло». В основе фамилии лежит личное именование или прозвище Бегло, а вот его происхождение вызывает споры. Есть две основные версии.

Первая связывает имя Бегло с тюрко-татарским составным именем Бегул. Первая часть — «би» или «бе» — восходит к диалектному варианту тюркского «бек» («князь, повелитель, начальник, господин»). Вторая часть — «гул» — переводится как «воин» или «раб божий». Родители, называя сына Бегулом, могли желать ему стать достойным мусульманином и знатным человеком. По этой версии, армянская фамилия Беглоян могла возникнуть в среде армян, испытавших сильное тюркское влияние, особенно в Западной Армении или среди армян-халкидонитов.

Вторая версия — чисто армянская. Именование Беглу могло произойти от названия рыбы «беглу» — севанского усача, который водится только в озере Севан. В древности у многих народов, в том числе у армян, были распространены имена, образованные от названий рыб (ср. славянское имя Сом). Не исключено, что Беглу было не именем, а прозвищем рыбака, которое затем закрепилось за его родом. Эта версия кажется не менее правдоподобной, учитывая географическую привязку к Армении.

Обе гипотезы имеют право на существование, но вторая — с рыбой — объясняет фамилию без привлечения тюркского материала, что для армянской ономастики встречается реже и потому интереснее. В любом случае, фамилия Беглоян говорит о древнем родовом прозвище, которое могло означать и «княжеского воина», и «рыбака с Севана».