Фамилия Бегоян — хороший пример того, как география и язык подсказывают происхождение. Это армянская фамилия, и ее структура прозрачна: основа Бего- плюс типичный армянский патронимический суффикс -ян (в дореволюционной орфографии — -янц), означающий «принадлежащий к роду» или «потомок». В русском языке такой суффикс читается как «ян», и фамилии на -ян — одни из самых распространенных среди армян.

Спор вызывает основа. Самая прямая версия — от армянского имени или прозвища Бег. Слово «бек» в тюркских языках означает «господин», «князь», «вождь». В Закавказье, веками находившемся под влиянием тюркской культуры, этот титул прочно вошел в армянский быт. Имя Бег или Бего могло быть как почетным прозвищем (например, для старшины общины или зажиточного крестьянина), так и сокращением от полного имени типа Беглар (от тюркского «бегляр» — «беки»). Соответственно, Бегоян — «потомок Бега» или «из рода Бегов».

Менее вероятная, но встречающаяся версия связывает фамилию с армянским словом «бег» (бегство) или глаголом «бегел» (бежать). В этом случае Бегоян могло бы означать «беглец» или «пришелец». Однако для прозвищ такое значение редкое и менее логичное, чем указание на социальный статус. Армянские фамилии чаще образовывались от имен, титулов или профессий, а не от абстрактных действий.

Фамилия Бегоян распространена в Армении и в армянских диаспорах России, Грузии, Ирана. Встречаются варианты написания: Бегоянц (старая форма) и Бегян (без гласной «о» в основе). Бегян — это отдельная, но однокоренная фамилия, где основа та же, а чередование «о/а» в корне — обычное явление для диалектов.

Сословно фамилия не маркирована: ее могли носить и крестьяне, и ремесленники, и мелкие землевладельцы. Титул «бек» в основе не гарантирует аристократического происхождения — в XIX веке его часто давали за заслуги или просто как уважительное обращение. Поэтому предки большинства современных Бегоянов были, скорее всего, уважаемыми людьми в своей общине, но не обязательно князьями.