Фамилия Бекетауов — редкий пример того, как тюркское именование обрастало русскими патронимическими суффиксами. Её основа — имя Бекетау, сложенное из двух частей: «бек» (господин, князь, начальник) и «тау» (гора). В тюркской ономастике такие двусоставные имена-пожелания давали, чтобы подчеркнуть высоту положения или силу духа: «Бекетау» можно понять как «князь-гора» или «господин, подобный горе». Встречается и менее поэтичная версия — что в основе лежит не имя, а прозвище человека, жившего у высокой горы или владевшего землёй у подножия.

Сама фамилия образована по классической русской модели: к основе Бекетау прибавили суффикс -ов, который в XVI–XIX веках стал универсальным способом русификации нерусских имён и прозвищ. Форма Бекетауов — не «Бекетаев» и не «Бекетауский» — указывает, что предок носителя фамилии, скорее всего, был казахом, башкиром или татарином, чьё родовое имя попало в официальные документы Российской империи. Суффикс -ов в данном случае не говорит о сословной принадлежности: такую фамилию могли записать и крестьянину, и служилому человеку.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу Казахстана и приграничным областям России — Оренбургской, Астраханской, Челябинской. Встречается также в Башкортостане, где имя Бекетау (в форме Биктау, Биктеу) известно как родовое среди башкирских тарханов и старшин. В метрических книгах XIX века попадаются варианты написания: Бекетаув, Бикетауов — что объясняется нестабильностью передачи тюркских звуков кириллицей.

Однокоренные фамилии — Бекетаев, Бектауов, Биктеев — различаются суффиксами, но восходят к тому же корню. Если Бекетауов — это «сын Бекетау», то Бекетаев — «сын Бекетая» (где -тай — уменьшительный аффикс). Вторая форма встречается чаще, но именно Бекетауов сохранила архаичную полную основу, что делает её интересным объектом для ономастики.