Фамилия Бекмагамбетова — это женская форма мужской фамилии Бекмагамбетов, которая напрямую указывает на происхождение от личного имени Бекмагамбет. В основе лежит сложносоставное тюркское имя, популярное в казахской и других тюркоязычных средах. Первая часть — «бек» (в тюркских языках — «господин», «князь», «вождь»), вторая — «магамбет» — это диалектный или фонетический вариант имени Мухаммед (Мухаммад). Таким образом, имя Бекмагамбет буквально означает «господин Мухаммед» или «князь Мухаммед», что подчеркивало уважение к пророку ислама и одновременно высокий социальный статус носителя.

Фамилия образована по типичной для русской и многих тюркских фамилий модели: к имени добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Это произошло в XIX–XX веках, когда у казахов и других народов Центральной Азии начали массово фиксировать фамилии по отчеству, используя русскую грамматику. Суффикс -ов здесь не несёт славянского значения принадлежности к роду, а служит формальным маркером фамилии.

Географически фамилия Бекмагамбетова и её мужской вариант наиболее распространены в Казахстане, особенно в западных и южных регионах (Атырауская, Мангистауская, Актюбинская области). Встречается она и среди казахов, живущих в России (Астраханская, Оренбургская области). Встречаемость фамилии в других странах, как правило, связана с миграцией.

Особенность этой фамилии — в её двойной культурной маркировке. С одной стороны, она несёт исламский пласт (имя пророка), с другой — тюркский титул «бек», который в кочевой среде означал не столько аристократа по крови, сколько уважаемого человека, предводителя рода или военачальника. Поэтому предки носителей фамилии, скорее всего, были людьми заметными в своей общине — аксакалами, батырами или влиятельными скотоводами. Споров о происхождении корня нет: имя Бекмагамбет хорошо задокументировано в казахской антропонимии.