Фамилия Бекмагамбетовы образована от составного мужского имени Бекмагамбет, где первая часть («бек») означает «господин, князь», а вторая восходит к диалектному варианту имени Мухаммет (араб. «восхваляемый, прославляемый») — Магамбет. Таким образом, имя Бекмагамбет буквально означает «господин Магамбет» или «князь Мухаммет».

Своими корнями фамилия уходит в XV–XVII века, в среду тюркских народов, испытавших влияние Золотой Орды. Словообразовательная модель проста: к основе имени добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Бекмагамбета»). Такая модель типична для фамилий, которые оформились у тюркских народов в период вхождения их земель в состав Российской империи.

В родословных записях о восточном происхождении фамилии Бекмагамбетовы сомневаться не приходится: имя родоначальника сохранило отчетливую тюрко-арабскую структуру. Проникновению подобных основ в русский фамильный состав способствовал исторический контекст: многие дворяне в России были по происхождению нерусскими, а местная знать из тюркской среды нередко получала фамилии по тому же принципу, что и русская аристократия.

Фамилия Бекмагамбетовы — не столько древняя восточная фамилия в прямом смысле, сколько памятник культурного и языкового контакта: тюркское имя с исламским корнем, записанное по русской грамматической модели. Встречается она прежде всего у казахов и башкир, а также у представителей других тюркоязычных народов, что указывает на её региональную и этническую привязку, а не на случайное заимствование.