Фамилия Беленышев образована от прозвища Беленыш, которое восходит к прилагательному «белый» - «светлый, бледный, белолицый, белокудрый». Вероятно, прозвище Беленыш указывало на внешние особенности предка Беленышевых: он был светловолосым, белокожим человеком. Возможно также, что прозвище Беленыш восходит к прилагательному «белый» в значении «милый, дорогой, хороший, чистый, незапятнанный». В таком случае прозвище Беленыш отражало особенности характера и поведения основателя фамилии Беленышев. Согласно еще одной гипотезе, Беленышем именовали «обеленного», то есть свободного от податей крестьянина.