Фамилия Белкова — русская, женского рода, но её разумнее рассматривать вместе с мужской формой Белков, от которой она образована. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Белка. Тут возможны два пути, и второй выглядит убедительнее.

Первая версия — прозвище Белка напрямую связано с одноимённым зверьком. В древнерусском языке слово «белка» имело ещё одно, редко вспоминаемое значение: самая мелкая металлическая платёжная единица Древней Руси. Если человек носил такое прозвище, он мог иметь отношение к торговле, обмену или сбору податей. Но чаще прозвищем Белка награждали за характер — шустрого, быстрого, непоседливого ребёнка, который вертится как белка в колесе.

Вторая, более вероятная версия, отталкивается от слова «белый». Форма Белок (с ударением на второй слог) — это вариант прилагательного «белый» в значении «светловолосый, бледнолицый, седой». От Белка через суффиксальную модель -ов образовалась фамилия Белков. Подтверждение этому находим в исторических документах: во второй половине XV века упоминается Иван Федорович Белка Отяев. Прозвище Белка здесь явно не звериное, а личное, цветовое.

Фамилия Белкова относительно редка. Её суффикс -ов указывает на типичную модель русских фамилий, закрепившуюся в центральных и северных регионах России. В отличие, скажем, от фамилии Белкин, которая образована от того же корня, но через суффикс -ин, что характерно для прозвищ, оканчивающихся на -а. В фамилии Белков мы видим более архаичную форму, где основа Белк- (от Белок) дала притяжательное значение «чей?» — «сын Белка».