Фамилия Беляниниов — редкий случай, когда двойной суффикс указывает не на географию, а на социальный статус. В русских фамилиях суффикс -инов обычно встречается у потомков священнослужителей: он образован от притяжательного прилагательного на -ин (чей? — Белянин) с добавлением фамильного -ов. То есть Беляниниов — это не «сын Белянина», а «сын Белянинова», что типично для фамилий, возникших в духовном сословии в XIX веке, когда семинаристам давали фамилии по имени отца или по прозвищу его самого.

Основа фамилии — прозвище Белян (или уменьшительное Беляня), которое в старину давали светловолосому, бледнолицему или просто чистому, опрятному человеку. Корень бел- — один из самых продуктивных в русской ономастике, но именно форма с суффиксом -ян (Белян) встречается реже, чем Белый или Беляк. Прозвище могло закрепиться за человеком, который выделялся внешностью, а не ремеслом.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России — Вологодской, Костромской, Ярославской. Там форма Белянинов (без второго «и») встречается в метрических книгах с XVIII века, а двойной суффикс -иниов — скорее всего, результат поздней канцелярской ошибки или местного произношения: в говорах могли говорить «Беляни́нов», а на письме закрепилось «Беляниниов» из-за путаницы с патронимическими формами.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает версию о церковном происхождении. Фамилии Беляев, Белов, Белкин — массовые, их носили крестьяне и мещане. А вот Белянинов и тем более Беляниниов — штучный товар: они почти всегда указывают на то, что предок был либо дьячком, либо пономарём, либо учился в семинарии. Двойной суффикс -иниов — редкая деталь, которая делает фамилию не просто указанием на внешность, а маркером сословной истории.