Фамилия Белышова — женская форма фамилии Белышов, а та образована от прозвища или неканонического имени Белыш. В русской ономастике суффикс -ыш не так част, как -ов или -ин, но он придаёт основе оттенок уменьшительности, ласкательности или, наоборот, пренебрежения. В данном случае Белыш — это «белый» человек: либо с очень светлыми волосами и кожей, либо, по более старой версии, «обеленный», то есть свободный от податей крестьянин. В Московской Руси «белыми» называли людей, не плативших государственных налогов (духовенство, служилые люди), и прозвище Белыш могло закрепиться за потомком такого льготника.

Словообразовательный разбор прост: корень бел- (цвет или социальный статус), суффикс -ыш (как в Голыш, Малыш, Черныш), далее фамильный суффикс -ов. Окончание -а указывает на женский род. Фамилия Белышов — типично русская, патронимическая по происхождению, то есть отвечает на вопрос «чей сын?» — сын Белыша.

Географически фамилия не привязана к какому-то одному региону, но по данным переписей XIX–XX веков чаще встречалась в северных и центральных губерниях: Вологодской, Архангельской, Костромской, а также на Урале. Это косвенно подтверждает версию о «белом» крестьянстве: именно на Русском Севере было много государственных (черносошных) крестьян, которых иногда называли «белыми» в отличие от частновладельческих.

Спорных версий немного. Иногда Белышов связывают с диалектным словом «белыш» — гриб-подберёзовик (в некоторых говорах), но это маловероятно: прозвища по грибам давали редко, а если и давали, то скорее в форме Беляк или Белый. Также есть гипотеза, что основа восходит к тюркскому «балык» (рыба), но для фамилии Белышова это натяжка — слишком далеко от русской фонетики и суффиксальной модели. Более правдоподобно считать, что Белыш — это просто вариант имени Беляй, Беляк, Белозёр, распространённых в допетровской Руси.

Таким образом, фамилия Белышова — редкий, но прозрачный по смыслу случай, когда за цветовой характеристикой может скрываться и социальный статус предка.