Фамилия Бенедис — редкий случай, когда западноевропейская письменная фиксация почти полностью скрыла славянское происхождение. Если смотреть на окончание, кажется, что перед нами латышский или литовский вариант (суффикс -ис типичен для прибалтийских фамилий). Но основа здесь — латинское Benedictus («благословенный»), которое через церковное имя Бенедикт разошлось по всей Европе. В славянских землях это имя давали при крещении, но в народе его переделывали: в польском варианте — Бенедикт, в украинском и белорусском — Бенедись, Бенедь, Беня.

Фамилия Бенедис, скорее всего, возникла на землях бывшей Речи Посполитой — в современной Беларуси, на востоке Польши или в Литве. Суффикс -ис указывает на литовскую или латышскую огласовку: в этих языках так оформляли мужские фамилии от личных имён. Но носителями были не обязательно литовцы — так могли писаться поляки, белорусы или евреи, чью фамилию записали по местной грамматике. В польской традиции та же основа дала бы фамилию Бенедикт, Бенедык или Бенедя.

Исходное значение — «сын Бенедикта» или просто «Бенедиктов». Человек, первым получивший такое прозвище, мог быть либо назван в честь святого Бенедикта Нурсийского (особо почитаемого в католичестве), либо сам носил это имя при крещении. В славянской среде имя Бенедикт было редким, чаще встречалось у шляхты и городского сословия, чем у крестьян. Поэтому фамилия Бенедис — не массовая, а точечная, привязанная к конкретным семьям, которые либо держались католической традиции, либо получили фамилию от ксёндза при записи в метрику.

Спорных версий у этой фамилии почти нет: корень прозрачный, искажения минимальны. Единственный нюанс — в некоторых русских говорах «бенедить» означало «важничать, ломаться», но это случайное созвучие, не имеющее отношения к латинскому имени. Фамилия Бенедис — это пример того, как церковное имя, пройдя через несколько языковых границ, закрепилось в форме, которая кажется чужой, но на деле рассказывает о смешанной культуре восточноевропейского пограничья.