Фамилия Беняминов — это типичный пример патронимической фамилии, образованной от полной формы личного имени. В основе лежит древнееврейское имя Бенямин (Биньямин), которое дословно переводится как «сын правой руки». В библейском контексте это имя приобрело переносное значение — «сын любимой жены», ведь так звали младшего сына патриарха Иакова и Рахили. Рождение Бенямина, согласно Книге Бытия, стоило жизни его матери, и Иаков, скорбя, называл его «сыном своей старости» — главным утешением после потери любимой жены. Имя распространено не только в иудейской, но и в мусульманской среде, где существует его форма Биньямин.

Суффикс -ов указывает на типичную для русских фамилий модель принадлежности: Беняминов — «сын Бенямина» или «из рода Бенямина». Такие фамилии обычно закреплялись у выходцев из духовного сословия, купечества или мещан, но могли появляться и у крещёных инородцев. Интересно, что в дореволюционных документах встречается и вариант написания с двумя «н» — Беннаминов, но современная орфоэпическая норма фиксирует именно Беняминов.

Сведения о конкретных носителях фамилии можно найти в сибирских архивах. Например, в томских источниках упоминаются Бенямин Вардаевич Беняминов (1928 года рождения), Вартан Ошанович Беняминов (1897 года рождения) и Иосиф Равович Беняминов (1934 года рождения). Эти записи позволяют предположить, что фамилия была характерна для армянских или ассирийских семей, переселившихся в Сибирь, — об этом говорят отчества Вардаевич и Ошанович, типичные для армянской ономастики. Таким образом, фамилия Беняминов могла закрепиться в среде крещёных армян или ассирийцев, принявших православие и получивших при крещении библейское имя.