Фамилия Бердикожаев образована от мужского имени Бердикожай. Оно, в свою очередь, является составным и восходит к двум тюркским словам: «берди» и «кожай». Слово «берди» в переводе с древнетюркского на русский язык означает «дар (божий)», «бог дал». Вторая основа имени Бердикожай – Кожай - восходит к персидской именной основе «хожа» («ходже») - «начальник, глава семьи, хозяин, владелец, господин, учитель, мудрец». В казахском языке имя Ходжа, происходящее от этого имени, произносится как Кожа. Компонент -ай представляет собой типичный для тюркских имен уменьшительный суффикс, который также имеет звательное значение (то есть присоединяется к имени при обращении). Вероятно, нарекая ребенка именем Бердикожай, родители желали своему сыну в будущем власти и богатства. Таким образом, потомок человека, которого звали Бердикожаем, со временем получил фамилию Бердикожаев.