Фамилия Бердюшин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет очевидного корня, связанного с птицами (от «бердюш» — это не «беркут» и не «бердыш»). Ключ к разгадке — в суффиксе и региональной привязке.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: основа + суффикс -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Бердюшин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Бердюша. Само имя Бердюша — это, скорее всего, производная форма от крестильного имени, например, от Варфоломей или Варда. В русских говорах было принято укорачивать длинные имена: Варфоломей — Варфоломка — Вардя — Бердя — Бердюша. Подобная трансформация (замена «В» на «Б» и добавление уменьшительного суффикса -юш-) встречается в народной этимологии, когда имя «перекраивалось» на более привычный лад.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным словом «бердюш» — так в некоторых областях называли бердыш (старинное холодное оружие). В этом случае прозвище Бердюша мог получить воин или оружейник. Однако эта гипотеза слабее, потому что прозвища от названий оружия обычно образовывались напрямую (Бердыш, Бердышев), а форма с уменьшительным суффиксом -юш- для такого значения нехарактерна.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России. Встречается в Воронежской, Ростовской областях, а также на Урале, куда переселенцы принесли её в XVIII–XIX веках. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — служилыми людьми, охранявшими южные границы.

Известных носителей с громкой исторической славой нет, что типично для фамилии, образованной от неканонической формы имени. Ценность Бердюшиных — в бытовой истории: за каждым таким родом стоит конкретный человек, которого в деревне звали Бердюшей, а его дети и внуки уже стали Бердюшиными.