Фамилия Бердюгина — женская форма фамилии Бердюгин. В её основе лежит прозвище Бердюга, которое, скорее всего, получил ремесленник, мастеровой человек. Дело в том, что в старину существовали слова «бердник» или «берденник»: так называли специалиста, который выделывал бёрда — гребни для ткацких станков. Прозвище Бердюга могли дать именно такому умельцу, а потом, по старой русской традиции, оно закрепилось за его детьми и внуками как фамильное имя.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русского севера и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын или дочь Бердюги). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образовывались от основ на согласный, -ин чаще присоединялся к основам на -а/-я, что как раз и произошло с прозвищем Бердюга.

Интересно, что фамилия Бердюгин (и Бердюгина) встречается не повсеместно, а с заметной концентрацией на Урале и в Зауралье. Это косвенно указывает на то, что её носители могли быть выходцами из переселенческих потоков XVII–XVIII веков, когда ремесленники, в том числе ткацкие мастера, осваивали новые земли. В некоторых говорах слово «бердюга» могло означать не только мастера, но и самого гребня, то есть прозвище могло быть ироничным — человека могли дразнить за худобу или угловатость, сравнивая с деталью станка. Однако версия с ремеслом выглядит убедительнее: прозвища по профессии давали чаще и они легче переходили в фамилии.

В современном русском языке слово «бёрдо» почти забыто, но фамилия Бердюгина сохранила память о старинном ткацком промысле.