Фамилия Бергаева — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а географическое название, причём нерусское. Скорее всего, она образована от топонима Бергау (Bergau) — так называется несколько небольших населённых пунктов в Германии, а также река в земле Шлезвиг-Гольштейн. Немецкое Bergau буквально означает «горный луг» (Berg — гора, Au — луг, пойма). Фамилии, образованные от названий мест, откуда человек родом, типичны для немецкой традиции, но в русском контексте они могли появиться благодаря переселенцам или выходцам из немецких колоний.

Суффикс -ев указывает на русскую адаптацию: Бергаев — это «сын того, кто из Бергау». При переходе в русскую среду окончание -ау отпало, а основа Берг- получила типичный для русских фамилий суффикс принадлежности. Важно, что фамилия пишется через «е» (Бергаева, а не Биргаева), что подтверждает сохранение исходного немецкого произношения.

Встречается версия, что основа Берг- восходит к тюркскому или кавказскому корню, где «берг» может означать «вершина» или «крепость». Однако для фамилии Бергаева эта гипотеза слабая — в тюркских языках подобные фамилии обычно образуются с суффиксами -лы, -ли, -оглу, а не -ев. К тому же география бытования фамилии (единичные случаи в центральной России и на Урале) больше указывает на позднее появление через немецкое посредничество, чем на древнюю тюркскую основу.

Носители фамилии Бергаева — это потомки либо немецких колонистов, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, либо людей, получивших прозвище по месту жительства у горного луга. Фамилия не получила широкого распространения, оставаясь штучной, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска — если вы Бергаева, то почти наверняка в вашем роду есть немецкий след, который можно проследить по архивным записям о поселениях.